MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanobacterium sp. SWAN-1 chromosome

Total Repeats: 15277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_015574	TC	3	6	2426494	2426499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14502	NC_015574	ATT	2	6	2426502	2426507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_015574	A	6	6	2426525	2426530	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14504	NC_015574	TACAT	2	10	2426554	2426563	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
14505	NC_015574	T	6	6	2426582	2426587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_015574	TGA	2	6	2426596	2426601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_015574	ATGAA	2	10	2426641	2426650	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_015574	TAA	2	6	2426655	2426660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14509	NC_015574	A	8	8	2426679	2426686	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14510	NC_015574	ATTA	2	8	2427949	2427956	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14511	NC_015574	ATTA	2	8	2427962	2427969	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14512	NC_015574	AAT	2	6	2428063	2428068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14513	NC_015574	TAA	3	9	2428082	2428090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14514	NC_015574	TCT	2	6	2429064	2429069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14515	NC_015574	T	7	7	2429073	2429079	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14516	NC_015574	TGTT	2	8	2429096	2429103	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14517	NC_015574	A	6	6	2429192	2429197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14518	NC_015574	AGC	2	6	2429703	2429708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14519	NC_015574	TTA	2	6	2429739	2429744	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14520	NC_015574	TTA	2	6	2429775	2429780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14521	NC_015574	A	6	6	2429809	2429814	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14522	NC_015574	TAT	2	6	2429821	2429826	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14523	NC_015574	G	6	6	2429928	2429933	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
14524	NC_015574	TCC	2	6	2429986	2429991	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14525	NC_015574	TGA	2	6	2430039	2430044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14526	NC_015574	ATT	2	6	2430083	2430088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14527	NC_015574	T	6	6	2430100	2430105	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14528	NC_015574	CTTA	2	8	2430118	2430125	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14529	NC_015574	A	8	8	2430159	2430166	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14530	NC_015574	AAC	2	6	2430217	2430222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14531	NC_015574	A	7	7	2430272	2430278	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14532	NC_015574	AAT	2	6	2430281	2430286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14533	NC_015574	TAA	2	6	2431587	2431592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14534	NC_015574	A	7	7	2431637	2431643	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14535	NC_015574	A	7	7	2431674	2431680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14536	NC_015574	A	7	7	2431691	2431697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14537	NC_015574	TAA	2	6	2431711	2431716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14538	NC_015574	TGA	2	6	2431721	2431726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14539	NC_015574	GATT	2	8	2432886	2432893	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14540	NC_015574	AAT	2	6	2432900	2432905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14541	NC_015574	T	6	6	2433863	2433868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14542	NC_015574	AGTT	2	8	2433925	2433932	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14543	NC_015574	TAAA	2	8	2433949	2433956	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14544	NC_015574	GACA	2	8	2433980	2433987	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
14545	NC_015574	C	6	6	2435593	2435598	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
14546	NC_015574	TA	3	6	2435627	2435632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14547	NC_015574	AT	3	6	2435646	2435651	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14548	NC_015574	GAATA	2	10	2435658	2435667	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
14549	NC_015574	A	7	7	2435679	2435685	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14550	NC_015574	ACA	2	6	2435691	2435696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14551	NC_015574	GATC	2	8	2435739	2435746	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
14552	NC_015574	TAAAAA	2	12	2435785	2435796	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14553	NC_015574	A	6	6	2435841	2435846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_015574	T	7	7	2437239	2437245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14555	NC_015574	T	6	6	2437249	2437254	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_015574	A	6	6	2437265	2437270	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_015574	T	8	8	2437321	2437328	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14558	NC_015574	TA	3	6	2437367	2437372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14559	NC_015574	AAT	2	6	2437385	2437390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14560	NC_015574	A	9	9	2438069	2438077	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14561	NC_015574	A	6	6	2438087	2438092	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14562	NC_015574	TCC	2	6	2438525	2438530	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14563	NC_015574	TA	3	6	2438543	2438548	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14564	NC_015574	GTTCA	2	10	2438609	2438618	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
14565	NC_015574	A	7	7	2438636	2438642	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14566	NC_015574	TCC	2	6	2439899	2439904	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14567	NC_015574	TAT	3	9	2439914	2439922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14568	NC_015574	TTGA	2	8	2439959	2439966	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14569	NC_015574	TA	3	6	2440020	2440025	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14570	NC_015574	TA	3	6	2440056	2440061	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14571	NC_015574	ATC	2	6	2440958	2440963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14572	NC_015574	CAT	2	6	2441004	2441009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14573	NC_015574	TCC	2	6	2441901	2441906	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
14574	NC_015574	AATT	2	8	2441912	2441919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14575	NC_015574	GAT	2	6	2441963	2441968	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14576	NC_015574	ATC	2	6	2442012	2442017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14577	NC_015574	CTTT	2	8	2443361	2443368	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14578	NC_015574	TAT	2	6	2443381	2443386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14579	NC_015574	TGC	2	6	2443408	2443413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14580	NC_015574	TGT	2	6	2443435	2443440	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14581	NC_015574	A	6	6	2443490	2443495	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14582	NC_015574	TAATA	3	15	2443529	2443543	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14583	NC_015574	AATATT	2	12	2443547	2443558	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14584	NC_015574	AT	4	8	2443559	2443566	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14585	NC_015574	AGA	2	6	2443602	2443607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14586	NC_015574	AAT	2	6	2443637	2443642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14587	NC_015574	A	8	8	2443658	2443665	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14588	NC_015574	A	7	7	2444459	2444465	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14589	NC_015574	CTAT	2	8	2444526	2444533	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
14590	NC_015574	ATTT	2	8	2444563	2444570	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14591	NC_015574	T	6	6	2444586	2444591	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14592	NC_015574	A	7	7	2444644	2444650	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14593	NC_015574	TTC	2	6	2444656	2444661	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14594	NC_015574	T	6	6	2446406	2446411	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14595	NC_015574	ATAA	2	8	2446472	2446479	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
14596	NC_015574	T	7	7	2446519	2446525	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14597	NC_015574	TTC	2	6	2446542	2446547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14598	NC_015574	T	6	6	2446558	2446563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14599	NC_015574	TCA	2	6	2447033	2447038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14600	NC_015574	TA	3	6	2447044	2447049	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14601	NC_015574	TCA	2	6	2447057	2447062	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14602	NC_015574	ATG	2	6	2447077	2447082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14603	NC_015574	ATT	2	6	2447089	2447094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14604	NC_015574	TA	3	6	2447116	2447121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14605	NC_015574	T	7	7	2447134	2447140	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14606	NC_015574	AATT	2	8	2447142	2447149	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14607	NC_015574	TGA	2	6	2447152	2447157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14608	NC_015574	AAT	2	6	2448008	2448013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14609	NC_015574	TAA	2	6	2448837	2448842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14610	NC_015574	TTA	2	6	2448884	2448889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14611	NC_015574	TGGAGT	2	12	2448894	2448905	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
14612	NC_015574	T	7	7	2449610	2449616	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14613	NC_015574	AAATT	2	10	2449617	2449626	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14614	NC_015574	ATT	2	6	2449646	2449651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14615	NC_015574	AAT	2	6	2449696	2449701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14616	NC_015574	GAA	2	6	2449721	2449726	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14617	NC_015574	TTC	2	6	2449842	2449847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14618	NC_015574	T	7	7	2451007	2451013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14619	NC_015574	TCCA	2	8	2451059	2451066	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
14620	NC_015574	TTA	3	9	2451067	2451075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14621	NC_015574	T	7	7	2451079	2451085	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14622	NC_015574	CTT	2	6	2451107	2451112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14623	NC_015574	ATC	2	6	2451215	2451220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14624	NC_015574	AAT	2	6	2451232	2451237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14625	NC_015574	T	6	6	2451240	2451245	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14626	NC_015574	ATC	2	6	2451246	2451251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14627	NC_015574	AACA	2	8	2452204	2452211	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
14628	NC_015574	AAATT	2	10	2452228	2452237	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14629	NC_015574	T	6	6	2452236	2452241	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14630	NC_015574	ATT	2	6	2452244	2452249	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14631	NC_015574	TTTC	2	8	2453046	2453053	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
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